La connaissance des interactions entre protéines est donc indispensable à la compréhension du fonctionnement de la cellule. Ces travaux portent sur l'exploitation des informations disponibles dans les bases de données publiques afin d'étudier, par des approches bioinformatiques, les relations entre les interactions protéiques et l'évolution moléculaire des protéines. Après la présentation d'un outil pour l'inférence d'interactions à partir des relations d'homologie, la conservation et la co-évolution des protéines impliquées dans les interactions chez différentes espèces de levures a été étudié. Un travail portant sur le lien qui existe entre la composition modulaire des protéines et les interactions protéiques est ensuite développé. Enfin, une nouvelle stratégie d'intégration de données a été appliquée à l'analyse des complexes protéiques. L'ensemble de ces résultats montrent qu'il existe une variété de mécanismes complexes dont l'élucidation nécessite à la fois des données de qualité en quantité importante et la mise au point de nouvelles approches in silico permettant l'intégration d'informations hétérogènes.
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