Devant l'intérêt croissant pour l'environnement et la conservation de la biodiversité, comprendre les principaux mécanismes des cycles biogéochimiques ayant lieu dans les écosystèmes coralliens et lagonaires est une priorité. Un modèle 3D couplé physique/biochéochimique a été mis en place sur le lagon de Nouvelle-Calédonie : un 'hot spot' de biodiversité sous l'influence de divers forçages d'origines naturelles et anthropiques. L'impact d'un évènement extrême La Nina (2008) causant de fortes précipitations et ainsi d'importants apports dans le lagon a été étudié. Les échanges complexes océan-lagon ont également été abordés via la modélisation de l'upwelling du Sud-Ouest engendré par les alizés. Le modèle 3D couplé 'on-line' a permis de montrer que la totalité du lagon était impactée par les apports des rivières et potentiellement ceux de l'océan du large. Il s'est révélé être un outil robuste pour l'étude de ces environnements complexes et très variables et peut ainsi représenter un support à la gestion des zones côtières ainsi qu'aux scientifiques pour la planification de campagne et l'analyse de données.
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