L'objectif de cette étude était d'optimiser une méthode de marquage fluorochromique par microscopie à épifluorescence pour des milieux liquides et de l'adapter aux milieux solides pour le dénombrement de bactéries soumises à des chocs osmotiques et thermiques. L'optimisation de ces méthodes a nécessité la validation des dénombrements par rapport à une méthode de référence (méthode de dénombrement sur gélose). Après dénombrement par microscopie à épifluorescence, les résultats ont montré que les méthodes d'épifluorescence étaient applicables aux milieux liquides avec des chocs osmotiques à 8 % de NaCl et avec des chocs thermiques à 60ºC. Le pourcentage de bactéries à membrane endommagée est fonction de l'intensité du choc et un fluorochrome (DAPI) permet de connaître la population totale. L'association de différents fluorochromes et d'une méthode de dénombrement sur milieu gélosé améliore considérablement la compréhension de l'évolution d'une population bactérienne soumise à un choc, en termes de population totale et de cellules endommagées.
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