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Le présent travail, est le fruit d'une étude qui s'est étalée sur la période 2010-2013, dont l'objectif est de déterminer la qualité physico-chimique et biologique des eaux de surface et souterraines du bassin versant de l'Oued Inaouen, d'identifier les éventuels polluants existants dans ces eaux et leurs origines, ainsi que de valoriser les déchets organiques et les margines par co-compostage. Pour cela, nous avons, d'une part, délimité la zone d'étude à 26 stations pour les eaux de surface et 54 pour les eaux souterraines et réalisé le suivi spatio-temporel des paramètres physico-chimiques, bactériologiques et des macro-invertébrés benthiques pendant deux ans (Novembre 2010 - Octobre 2012). D'autre part, nous avons élaboré un compost par l'addition des margines sur un mélange homogène des déchets verts et des fientes de volailles jusqu'à l'obtention du taux d'humidité recommandé par les normes de qualité d'un fertilisant biologique. Les résultats des analyses ont fait ressortir une différentiation spatio-temporelle, le long du bassin versant de l'Oued Inaouen, à la suite d'intervention des facteurs naturels et anthropiques.
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